福岡軟銀鷹1 月 25 日宣布藤井皓哉投手在佐賀市的醫院成功接受右肘內側副韌帶重建手術（俗稱 Tommy John 手術）和關節清潔手術。預計他還要12個月才能重返賽場，本季無望投球。

藤井一月就感到右手肘不適，並於2月17日參加了宮崎訓練營。 20日，他首次進行了對著捕手投球練習，但21日右手肘再次出現不適症狀。當天，他便離開了宮崎訓練營，返回福岡。

上個賽季，他與杉山和松本豐組成了獲勝「基朱三人組」。他出戰51場，取得2勝3中繼成功19次救援成功，防禦率1.44。他的離開對球隊衝擊聯賽三連霸無疑是一次沉重的打擊。